Noua instituţie va prelua Laboratorul Central Fitosanitar, Agenţia Naţională Fitosanitară (ANF) din cadrul Ministerului Agriculturii şi Dezvoltării Rurale (MADR) şi unităţile fitosanitare din cadrul Direcţiilor pentru Agricultură judeţene.

Potrivit unui Proiect de reorganizare al MADR, Autoritatea Naţională Fitosanitară, care va funcţiona în subordinea MADR,  este "autoritatea competentă de reglementare şi control în domeniul fitosanitar, respectiv al organizării şi funcţionării sistemelor de protecţie a plantelor, de omologare, comercializare, utilizare şi control al calităţii produselor de protecţe a plantelor, al reziduurilor de pesticide în plante şi produse vegetale, precum şi al utilizării durabile a pesticidelor" şi va realiza venituri proprii prin perceperea de taxe şi tarife pentru serviciile prestate, aprobate prin Ordin al MADR, la propunerea ANF. Pentru realizarea obiectivelor din domeniul sau de activitate, Autoritatea Naţională Fitosanitară  va exercita următoarele funcţii: de reglementare, prin care se va asigura realizarea cadrului juridic; de supraveghere şi control al aplicării şi respectării reglementărilor; de strategie şi administrare a structurilor din subordine; de reprezentare  pe plan intern şi extern. De asemenea, ANF va: organiza, coordona şi asigura asistenţă tehnică in domeniul fitosanitar pe întreg teritoriul României; elabora strategia în domeniul fitosanitar, în concordanţă cu politicile, legislaţia şi normele Uniunii Europene; va elabora şi promova proiecte de acte normative; organiza şi coordona activitatea Direcţiei Fitosanitare a Laboratorului Naţional Fitosanitar şi a centrelor fitosanitare regionale; va organiza şi coordona activitatea poliţiei fitosanitare; va asigura gestionarea, implementarea cerinţelor de eco-condiţionalitate şi controlul  privind introducerea pe piaţă a produselor de protecţie a plantelor (SMR), în colaborare cu APIA; asigura informarea şi constientizarea fermierilor asupra bunelor practici agricole şi de mediu, precum şi asigurarea expertizei de specialitate pentru implementarea PNDR 2014-2020; va participa la elaborarea Planului National Unic de Control Integrat (PNCUI) etc. De asemenea, ANF va avea ca atribuţie organizarea sistemului naţional de omologare şi reomologare a produselor de protecţie a  plantelor, prin coordonarea activităţii de evaluare a dosarelor substanţelor active în vederea aprobării  sau reaprobării acestora, în calitate de stat membru raportor/ coraportor, după caz, a celei privind evaluarea dosarelor produselor de protecţie a plantelor în vederea omologării/reomologării acestora. Totodată,  instituţia va asigura controlul postomologare privind comercializarea şi utilizarea produselor de  protecţie a plantelor, respectarea legislaţiei privind importul şi circulaţia intracomunitară a produselor de protecţie a plantelor, implementarea legislaţiei, a măsurilor şi acţiunilor subsumate îndeplinirii obiectivelor generale şi specifice din cadrul Planului naţional de actiune privind diminuarea riscurilor asociate utilizării produselor de protecţie a plantelor împreună cu alte instituţii şi organisme publice etc.